Fundado en los albores del siglo XV, el pueblo recogió el nombre del conquistador de la isla Jean de Bethencourt, que capturó Betancuria en 1405. La Catedral, Santa Maria de Betencuria, sufrió muchos ataques de Xaban Arraez y la mayor parte fue destruida. En 1620 los habitantes locales reconstruyeron la iglesia tal como se ve hoy en día.
Mención especial requiere 'La Capilla de San Diego' y 'La Capilla del Monasterio' en cuya pared todavía se puede ver la fundación del primer convento franciscano de las Islas Canarias, que a su vez fue el hogar de San Diego de Alcala
Betancuria es un lugar que debe ser incluido en cualquier itinerario que se realice al visitar Fuerteventura.